О проекте
Координатор проекта
Руководители клинической части
Сакаева Д.Д.ФГБОУ ВО БГМУ, Уфа
Еникеев Р.Ф.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Клиническая часть
Сафина С.З.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Дружков М.О.Клиника «Дружковых», Казань
Овчинникова Е.Н.ГБУЗ НО «НОКОД», Нижний Новгород
Мухамедьярова Г.К.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Исянгулова А.З.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Петкау В.В.ГБУЗ СО СООД, Екатеринбург
Ершова М.М.ГБУЗ СО СООД, Екатеринбург
Мухаметшина Г.З.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Гамаюнов С.В.МРНЦ им. А.Ф. Цыба – фил. ФГБУ «НМИЦ радиологии», Обнинск
Филатов П.Н.ГБУЗ "ООКОД" Оренбург
Дикарева Е.Л.НМИЦ им. В. А. Алмазова, Санкт-Петербург
Шумская И.С.«Медис», Нижний Новгород
Хасанов Р.Ш.КГМА - филиал ФГБОУ ДПО РМАНПО, Казань
Султанов Р.З.ГАУЗ РКОД МЗ РБ, Уфа
Королева И.А.Медицинский Университет "Реавиз", Самара
Хайруллин И.И.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Исмагилов А.Х.КГМА - филиал ФГБОУ ДПО РМАНПО, Казань
Насретдинов А.Ф.ГАУЗ РКОД МЗ РБ, Уфа
Ахмадуллина С.Р.АУ РКОД МЗ ЧР, Чебоксары
Гусева И.В.ГБУЗ ООД, Пенза
Бурмистров М.В.ГАУЗ РКБ МЗ РТ, Казань
Бузова Н.Л.АУ РКОД МЗ ЧР, Чебоксары
Репин К.Г.БУЗ УР «РКОД им. С. Г. Примушко МЗ УР», Ижевск
Пьянков С.В.БУЗ УР «РКОД им. С. Г. Примушко МЗ УР», Ижевск
Рамазанова М.С.КОГБУЗ КОКОД, Киров
Минабетдинова Р.Р.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Шерман Н.З.КОГБУЗ КОКОД, Киров
Данилова Л.А.ГУЗ ОКОД, Ульяновск
Хамитов М.Р.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Чичканова А.С.ФБУЗ ПОМЦ ФМБА, Нижний Новгород
Фаисханова Р.Р.ГАУЗ РКОД МЗ РБ, Уфа
Моляко Ю.КГБУЗ КОД№1, Краснодар
Никитина Е.Н.КОГБУЗ КОКОД, Киров
Гильфанова З.Ф.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Иванов А.Н.АУ РКОД МЗ ЧР, Чебоксары
Никитина Л.Ю.ГБУЗ "ООКОД" Оренбург
Гатауллин Б.И.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Деньгина Н.В.ГУЗ ОКОД, Ульяновск
Водолагин А.В.ГУЗ "СГП № 19", Саратов
Шигапова Л.Н.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Агуллина М.В.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Ахметзянова А.В.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Лядов В.К.ФГБОУ ДПО РМАНПО, Москва
Аксарин А.А.БУ СОКБ, Сургут
Михеева Ю.В.ФГБУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет»
Андрияшкина И.И.МНКЦ имени А.С. Логинова, Москва
Лабораторная часть
Шигапова Л.Х.ФГОУ ВПО КФУ, Казань
Техтелева И.С.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Лоскутова Е.Ф.ГАУЗ РКОД МЗ РТ, Казань
Гусев О.А.ФГОУ ВПО КФУ, Казань
Шагимарданова Е.И.ФГОУ ВПО КФУ, Казань
Спешилов Г.И.ООО "Геномный центр РидСенс", Троицк
Биоинформационная часть
Никитин А.Г.ФГБУ НИИ Пульмонологии ФМБА России, Москва
Бровкина О.И.ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, Москва
Ходырев Д.С.ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, Москва
Создание и поддержка сайта
Карпан НиколайМосква
При участии
Блохина М.Е.AstraZeneca, Москва
Карасева В.В.Российское общество клинической онкологии (RUSSCO), Москва
При поддержке
Карпова И.Ю.Roche Diagnostics Rus, Москва
Преснякова М.А.QIAGEN Russia, Москва
История проекта
В 2009-2011 гг. коллективом сотрудников Республиканского Онкологического Диспансера (Еникеев Р.Ф., Дружков М.О., Гордиев М. Г.) и Алексеем Никитиным (ФГУП "ГосНИИгенетика", Москва) было инициировано исследование по изучению частот мутаций в генах, отвечающих за предрасположенность к раку молочной железы (гены системы HRR) среди жительниц Республики Татарстан. Вскоре к проекту присоединился Олег Гусев (КФУ, Казань) отвечающий за лабораторную часть исследования.
Задачей являлось изучение частот наследственных мутаций в генах, отвечающих за репарацию ДНК, в группе больных раком, включающей в себя следующие синдромы:
- Наследственный рак молочной железы и яичников;
- Синдром Линча;
- Наследственный диффузный рак желудка;
- Наследственная гастроинтестинальная стромальная опухоль;
- Наследственный рак поджелудочной железы;
- Семейный аденоматозный полипоз;
- Ювенильный полипоз;
- Полипоз, ассоциированный с дефектом активности полимераз;
- Наследственный синдром смешанного полипоза;
- Синдром семейных атипичных родинок и меланомы;
- Синдром Ли-Фраумени;
- Синдром Коудена;
- Синдром Пейтца-Егерса;
- Множественная эндокринная неоплазия второго типа;
- Болезнь Гиппеля-Линдау;
- Наследственная феохромоцитома;
- Опухоли, ассоциированный с мутациями в генах ATM, BAP1, BARD1, BRIP1, CHEK2, MRE11, NBN, PALB2, RAD50, RAD51B, RAD51C, RAD51D.
Изначально в исследовании участвовали жители Татарстана и только по наследственному раку молочной железы, но на более поздних этапах к исследованию были подключены и представителях других регионов России – Республики Башкортостан, Удмуртской Республики, и т.д.
За 2013-2020 гг. было проанализировано более 2000 случаев ЗНО с признаками наследственных синдромов (рак молочной железы, рак яичников, колоректальный рак, рак эндометрия, нейроэндокринный рак, рак пищевода, и т.д.), на сегодняшний день исследование продолжается.
Частоты вариантов в российской популяции
Данные по частотам в экзомах взяты из проекта "Российские экзомы", авторы Юрий Барбитов, Ростислав Скитченко, Ольга Полещук, Антон Шиков, Елена Серебрякова, Юлия Насыхова, Дмитрий Полев, Анна Шувалова, Ирина Щербакова, Михаил Федяков, Олег Глотов, Александр Предеус.
Публикации
1. Nikitin A.G., Chudakova D.A., Enikeev R.F., Sakaeva D., Druzhkov M., Shigapova L.H., Brovkina O.I., Shagimardanova E.I., Gusev O.A., Gordiev M.G. 2020. Lynch Syndrome Germline Mutations in Breast Cancer: Next Generation Sequencing Case-Control Study of 1,263 Participants. Front. Oncol. 10 (666).
2. Никитин А.Г., Бровкина О.И., Ходырев Д.С., Гусев О.А., Гордиев М.Г. 2020. Опыт создания публичной базы данных мутаций oncoBRCA: биоинформационные проблемы и решения. Клиническая Практика. 11 (1), 21–29.
3. Brovkina O.I., Shigapova L., Chudakova D.A., Gordiev M.G., Enikeev R.F., Druzhkov M.O., Khodyrev D.S., Shagimardanova E.I., Nikitin A.G., Gusev O.A. 2018. The Ethnic-Specific Spectrum of Germline Nucleotide Variants in DNA Damage Response and Repair Genes in Hereditary Breast and Ovarian Cancer Patients of Tatar Descent. Front. Oncol. 8 (a421), 1–9.
4. Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Еникеев Р.Ф., Дружков М.О., Шигапова Л.Х., Шагимарданова Е.И., Гусев О.А., Косый В.В., Ходырев Д.С., Кедрова А.Г., Хасанов Р.Ш., Никитин А.Г. 2017. Гены системы репарации: популяционные различия наследственных типов рака яичников и молочной железы, выявляемые методом секвенирования нового поколения. Опухоли Женской Репродуктивной Системы. 13 (2), 61–67.
5. Хасанова А.И., Гордиев М.Г., Ратнер Е.Ю., Жаворонков В.В., Хасанов Р.Ш., Никитин А.Г. 2016. BRCA-ассоциированный рак молочной железы у представительниц татарской национальности на примере клинического случая. Поволжский онкологический вестник. 26 (2), 104–108.
6. Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Шигапова Л.Х., Дружков М.О., Шагимарданова Е.И., Еникеев Р.Ф., Ходырев Д.С., Гусев О.А., Никитин А.Г. 2016. Гены BRCA1 и BRCA2: популяционные особенности развития рака молочной железы у татарских женщин. Медицинская генетика. 15 (10), 50–52.